Освоение этих земель европейцами началось в 1501 г. конкистадором Родриго де Бастидас. Свой статус Департамент Чоко получил в 1947 г. Население - преимущественно африканцы.

На территории Департамента находится Национальный природный парк Лос-Икатиос, объявленный ЮНЕСКО достоянием человечества. Биоразнообразие региона уникально, некоторые виды флоры и фауны не встречаются больше нигде. Чоко также знаменит тем, что является одним из мировых регионов с самыми высокими показателями выпадения осадков в год.

Чоко имеет самые большие в стране запаси золота и платины, по добыче которых Колумбия занимает высокие позиции на континенте. Также добывается медь и нефть, проводится лесозаготовка. Тем не менее, департамент можно сравнить с Сибирью или с Дальним Востоком - количество природных богатств в регионе отнюдь не даёт благополучия его жителям. Чоко - одна из территорий с наименее развитой инфраструктурой в стране.